Zasady losowania grup
20 uczestników zostało podzielonych na 5 czterozespołowych grup. Przed losowaniem utworzone zostały trzy koszyki. W pierwszym znalazło się pięć najwyżej sklasyfikowanych drużyn z Ligi A, w drugim – szósta z drużyn z Ligi A oraz drużyny z lig B1 i B2, a w trzecim – drużyny z Ligi C.
System rozgrywek
Do ćwierćfinałów awansują zwycięzcy grup oraz jedna z drużyna z 2. miejsca – z najlepszym bilansem. Pozostałe cztery drużyny z 2. miejsc zagrają ze sobą mecze 1/8 finału o awans do ćwierćfinału.
Terminarz
Pierwsze mecze fazy grupowej zostaną rozegrane we wtorek, 18 października 2016 roku. Terminarz zostanie ogłoszony w niedzielę, 16 października w godzinach wieczornych. Jesienią zostanie rozegrana faza grupowa oraz mecze 1/8 finału. Ćwierćfinały oraz kolejne fazy Pucharu Ligi zostaną rozegrane wiosną 2017 roku.
